Omics Omics Omics: Un análisis predice un fármaco para tratar el cáncer de ovario

El cáncer de ovario es uno de los cánceres más desafiantes que afectan el sistema reproductivo femenino, siendo el carcinoma seroso de ovario de alto grado (HGSOC) el más mortal. Este tipo de cáncer, como muchos otros, no está provocado por una única mutación, lo que hace que sea más difícil de tratar. Debido a esto, en lugar de observar secuencias de ADN, el equipo se centró en los perfiles epigenéticos: los interruptores de encendido/apagado dentro de un tipo de célula específico que afectan la expresión genética y, en este caso, conducen a la formación de tumores.

El HGSOC se origina en las trompas de Falopio y los casos más graves no responden a la quimioterapia. Los investigadores se centraron en este tipo de tumor utilizando células derivadas de células epiteliales de las trompas de Falopio humanas, que cultivaron en diversas condiciones y estudiaron mediante un análisis ómico integrativo especial. «Este análisis integra y analiza una gran cantidad de datos de múltiples técnicas de alto rendimiento, incluidas ATAC, ChIP y secuenciación de ARN, para obtener una comprensión holística de los sistemas biológicos complejos», dice Machino.

El análisis multiómico predijo que los factores específicos que controlan la expresión genética se comportan de manera anormal durante la tumorigénesis ovárica. Esto ha llevado a un tratamiento potencial para el carcinoma seroso de ovario de alto grado, uno de los cánceres más mortales que no responde bien a la quimioterapia.

El análisis multiómico predijo que los factores específicos que controlan la expresión genética se comportan de manera anormal durante la tumorigénesis, justo cuando las células pasan de normales a cancerosas. Estas predicciones se probaron comparando los niveles de proteína entre células normales y cancerosas. La predicción se cumplió y los investigadores descubrieron que ciertas proteínas, conocidas como complejo AP-1, eran hiperactivas en las células cancerosas. Estas proteínas desempeñan un papel en impulsar el crecimiento y la propagación de las células cancerosas. Además, se descubrió que otro conjunto de proteínas, la familia GATA, que normalmente ayuda a controlar el comportamiento celular, era menos eficaz en las células cancerosas.

El análisis también identificó genes específicos:MAF, GATA6y DAB2 – que desempeñan un papel crucial en el control del crecimiento del cáncer. En la tumorigénesis temprana, estos genes fueron reprimidos epigenéticamente, lo que contribuyó a la formación de tumores. Al comprender cómo la supresión de estos genes conducía a la disfunción, los investigadores pudieron deducir una contramedida. «Nos dimos cuenta de que la culpable era la activación excesiva de Ras como resultado de la supresión del gen epigenético», dice Machino, «y razonamos que un fármaco que pudiera bloquear los eventos en esta vía cambiaría la tendencia». Cuando se probaron con trametinib, un fármaco clínicamente aplicable que puede inhibir la señalización de Ras, observaron signos de control epigenético normal, incluida la desupresión de MAF y DAB2.

Los medicamentos como trametinib se denominan inhibidores de MEK y este estudio predice que pueden ser eficaces para prevenir la tumorigénesis en el cáncer de ovario. Además, restringido MAF, GATA6y DAB2 pueden ser biomarcadores útiles. «Los biomarcadores HGSOC que descubrimos tienen el potencial de usarse para la detección temprana del cáncer de ovario», dice Machino. «Los hallazgos también apuntan a nuevos enfoques terapéuticos que podrían tener un impacto significativo en la sociedad».